文章目录

1 结果与分析

1.1 转录组测序质量评估

1.2 表达基因筛选

1.3 表达基因功能注释和富集分析

1.4 表达基因的细胞功能和代谢通路分析

2 讨论

3 材料与方法

3.1 样品采集

3.2 RNA质量分析

3.3 聚类和排序

3.4 质量控制

3.5 比较分析

3.6 基因表达定量分析

3.7 基因功能注释

作者贡献

文章摘要:肉牛的性成熟受下丘脑-垂体-卵巢（HPO）轴的调节,但其具体作用机制尚不清楚。为了探讨HPO轴繁殖相关基因和调控机制,采用高通量转录组RNA-seq技术,研究了成年安格斯牛（30个月大）的下丘脑、垂体和卵巢。结果表明,HPO共有18 179个基因在GO （基因本体论）中注释,37 158个基因在KEGG （京都基因百科全书和基因组）中注释,36 645个基因在KOG （KEGG同源数据库）中注释。GO分析表明,HPO富集了8种生殖相关功能,主要是受精、单个组织生殖过程、子宫胚胎发育和雌激素反应。KEGG分析发现,HPO富集300条信号通路（SP）,主要是癌症SP和磷脂酰肌醇3激酶蛋白激酶（PI3K-Akt）SP。与生殖有关的SPs共有16条,主要是Notch SP、神经营养素SP、哺乳动物雷帕霉素（mTOR） SP和血管内皮生长因子（VEG F） SP。为今后肉牛繁殖性能的提高、分子育种和同行参考提供了科学依据。

文章关键词:

项目基金:《今日畜牧兽医》 网址: http://www.jrcmsy.cn/qikandaodu/2021/1028/923.html